Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Otx1P80205 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Otx1P80205 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Otx1P80205 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx1P80205 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx1P80205 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx1P80205 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx1P80205 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx1P80205 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms