Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Polr1bP70700 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr1bP70700 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms