Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb6P70689 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb6P70689 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb6P70689 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms