Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Erbb2P70424 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Erbb2P70424 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erbb2P70424 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms