Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shox2P70390 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shox2P70390 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms