Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad50P70388 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad50P70388 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad50P70388 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad50P70388 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad50P70388 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms