Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp4P70343 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp4P70343 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp4P70343 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms