Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vamp7P70280 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp7P70280 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp7P70280 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.4 ms