Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfixP70257 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NfixP70257 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfixP70257 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfixP70257 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfixP70257 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfixP70257 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfixP70257 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfixP70257 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NfixP70257 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfixP70257 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfixP70257 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfixP70257 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NfixP70257 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfixP70257 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfixP70257 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfixP70257 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfixP70257 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfixP70257 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfixP70257 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfixP70257 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfixP70257 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfixP70257 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfixP70257 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfixP70257 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfixP70257 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfixP70257 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfixP70257 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfixP70257 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms