Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acta1P68134 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acta1P68134 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta1P68134 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta1P68134 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta1P68134 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms