Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actg2P63268 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg2P63268 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg2P63268 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg2P63268 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms