Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cplx1P63040 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cplx1P63040 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cplx1P63040 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms