Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hspd1P63038 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hspd1P63038 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hspd1P63038 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hspd1P63038 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hspd1P63038 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hspd1P63038 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspd1P63038 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms