Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp3P63024 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp3P63024 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms