Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uba52P62984 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba52P62984 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uba52P62984 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uba52P62984 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms