Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2bP62915 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms