Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElobP62869 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElobP62869 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ElobP62869 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ElobP62869 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ElobP62869 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ElobP62869 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ElobP62869 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ElobP62869 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ElobP62869 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ElobP62869 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms