Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl23P62830 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl23P62830 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms