Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vsnl1P62761 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vsnl1P62761 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vsnl1P62761 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms