Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hpcal1P62748 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpcal1P62748 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms