Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acta2P62737 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acta2P62737 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acta2P62737 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acta2P62737 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms