Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps4xP62702 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps4xP62702 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms