Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arf6P62331 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Arf6P62331 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arf6P62331 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms