Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan5P62080 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan5P62080 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms