Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch1P62046 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch1P62046 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch1P62046 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms