Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vbp1P61759 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vbp1P61759 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms