Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga11P61622 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga11P61622 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga11P61622 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga11P61622 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms