Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd6P61407 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd6P61407 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd6P61407 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd6P61407 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd6P61407 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd6P61407 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd6P61407 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms