Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf13P61216 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf13P61216 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf13P61216 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf13P61216 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms