Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Siah1aP61092 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah1aP61092 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1aP61092 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms