Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2kP61087 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms