Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup43P59235 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup43P59235 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup43P59235 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup43P59235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms