Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf2P59222 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarf2P59222 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms