Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcif1P59114 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcif1P59114 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcif1P59114 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms