Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp1P59054 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csrnp1P59054 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms