Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdrg1P59048 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms