Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm6sf1P58749 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm6sf1P58749 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm6sf1P58749 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm6sf1P58749 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms