Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp1P58466 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms