Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtdsplP58465 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtdsplP58465 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms