Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl4P58321 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl4P58321 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl4P58321 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms