Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smpdl3bP58242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms