Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snrpa1P57784 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snrpa1P57784 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snrpa1P57784 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms