Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctbp2P56546 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261 ms