Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GferP56213 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GferP56213 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GferP56213 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GferP56213 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GferP56213 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GferP56213 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GferP56213 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GferP56213 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GferP56213 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GferP56213 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GferP56213 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GferP56213 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GferP56213 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms