Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pex2P55098 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms