Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Faf1P54731 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Faf1P54731 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Faf1P54731 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms