Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CebpaP53566 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms