Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apobec1P51908 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec1P51908 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec1P51908 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms