Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1swP51491 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn1swP51491 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn1swP51491 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms