Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CastP51125 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CastP51125 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CastP51125 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CastP51125 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CastP51125 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CastP51125 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CastP51125 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CastP51125 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CastP51125 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CastP51125 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CastP51125 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CastP51125 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CastP51125 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CastP51125 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CastP51125 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CastP51125 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CastP51125 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CastP51125 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CastP51125 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CastP51125 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms